Écosystème de notes

Transformer la littérature en savoir réutilisable.

CardiOX Atomic est un plugin Obsidian qui relie Zotero à un système de notes atomiques. Chaque article lu devient un réseau de notes classées, dédupliquées et reliées — pas une archive morte.

Ma méthode

Le pipeline Zotero → notes atomiques → MOC, étape par étape.

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Plugins

Mes extensions Obsidian & Zotero pour fluidifier la prise de notes.

Voir les plugins →

Tips & tricks Bientôt

Configuration et astuces Obsidian + Zotero, pas à pas.

Construire un second cerveau clinique.

Du contenu de rythmologie, une méthode de prise de notes, et des outils open source.

Le pipeline

De Zotero à la carte de synthèse.

15

dimensions de taxonomie

3

plugins maison

2

applications socles

01

Zotero

Lecture et surlignage des PDF. Les références sont gérées via Better BibTeX.

02

Highlights 🧠

Les surlignages deviennent des fragments sourcés, prêts à citer.

03

Notes 🤖

Génération et classement selon une taxonomie à 15 dimensions.

04

MOC

Une carte de synthèse par article relie toutes les notes entre elles.

Arborescence des notes atomiques dans Obsidian

CardiOX Atomic

Une idée, une note.

  • Une idée = une note : des notes vraiment atomiques, réutilisables dans plusieurs contextes.
  • Taxonomie à 15 dimensions pour classer chaque note (type, niveau de preuve, thème…).
  • Préfixes d’origine 🧠 (surlignage) / 🤖 (IA) avec déduplication — « le highlight gagne ».
  • MOC (Map of Content) générée par article : un point d’entrée vers toutes ses notes.
  • Cache d’analyse par article pour des regénérations rapides et reproductibles.
Exemple de note atomique de conclusion
Carte de synthèse (MOC) générée pour un article

Synthèse

Une carte par article.

La MOC (Map of Content) rassemble, pour chaque publication, ses conclusions, concepts et figures en un seul point d’entrée. C’est le pont entre la lecture et la réutilisation : retrouver une idée, la citer, la relier à une autre.

Le traitement des surlignages distingue l’origine de chaque note — 🧠 highlight 🤖 IA — et déduplique automatiquement.

L’écosystème

Trois plugins, un flux de travail.

CardiOX Atomic

Le cœur du système : Zotero → notes atomiques classées + MOC par article.

CardiOX RefNotes

Gestion des références et des citations : des liens propres entre notes et sources.

CardiOX Sketchnote

Schémas et sketchnotes pour visualiser les mécanismes et les algorithmes décisionnels.

Plugins Obsidian développés pour le projet CardiOX, en cours de consolidation. Le contenu produit reste à visée éducative et ne constitue pas un avis médical.